La afirmación de que Gueshe Kelsang estaba demasiado enfermo para dedicarse a extensos retiros antes de venir a Occidente es falsa. Gueshe Kelsang realizó retiros de meditación en solitario durante muchos años y fue un meditador muy consumado. Éste y otros rumores proceden explícitamente de la carta políticamente motivada y objetivamente inexacta que el monasterio Sera Je de la India envió a Gueshe Kelsang, «expulsándole» del monasterio en el que se había graduado décadas antes, y que fue citada en 1996 en The Tibetan Review de la revista Snow Lion Magazine. Cuando Gueshe Kelsang fue entrevistado al respecto en noviembre de 1996, respondió

Hice un largo retiro durante muchos años en Nepal, cerca de la frontera con el Tíbet, en la región del Himalaya. El lugar se llama Bangthog Damthang, y me patrocinó mi hermana Dekyi, que ahora vive en Suiza. Más tarde, hice muchos retiros largos en las montañas de Dalhousie, cerca de Dharamsala. En Mussourie, cada invierno durante varios meses hice retiro. Cuando no estaba en retiro, intentaba ayudar a las familias realizando rituales de curación y pujas especiales. Antes de ir a Mussourie vivía en Buxa y allí enfermé de infecciones recurrentes en el pecho, pero no era grave. Más tarde, en Mussourie las infecciones de pecho siguieron reapareciendo, pero nunca me ingresaron en el hospital. En toda mi vida no he pasado ni una sola noche en el hospital. Mis parientes de Mussourie me insistieron en que me hiciera un chequeo completo, así que me examinaron tres médicos distintos. Dos de ellos dijeron que no tenía ninguna enfermedad, pero que necesitaba fortalecer mi cuerpo, y un médico dijo que tal vez tenía tuberculosis. En realidad era difícil comprender el verdadero problema. Más tarde, cuando vivía en Inglaterra, experimenté una continua debilidad física hasta que finalmente fui con dos asistentes occidentales a Londres durante tres semanas y me examinaron dos especialistas. Me hicieron muchas radiografías y muchas otras pruebas. El resultado final fue que ambos médicos dijeron que no había ninguna enfermedad, sólo debilidad pulmonar. Dijeron que necesitaba aire fresco, sol, ejercicio y descanso para fortalecerme».

Gueshe Kelsang también hizo un retiro de tres años en Escocia, de 1987 a 1990. Entre sus sesiones de meditación, Gueshe Kelsang continuó trabajando en varios libros, y fue en esta época cuando completó Camino gozoso de buena fortuna y Compasión universal, y escribió El manual de meditación, Introducción al budismo y Guía del paraíso de las Dakinis. También fue durante este periodo cuando diseñó los tres programas espirituales que forman el núcleo de la Nueva Tradición Kadampa.

¿Fue asesinado Gueshe Kelsang?

Una teoría relacionada que siguen repitiendo algunos «supervivientes» de la Nueva Tradición Kadampa es que Gueshe Kelsang estaba tan enfermo que se mantuvo oculto a sus estudiantes durante décadas. Otra teoría conspirativa es que murió, a veces incluso que fue asesinado, y que una siniestra cábala de directivos de la NKT pasó años encubriéndolo. Nada de esto es cierto.