La Comunidad Internacional Shugden (ISC) se creó a finales de los 90 para organizar protestas contra la prohibición del Dalai Lama de la práctica del Protector del Dharma de Doryhe Shugden y la consiguiente represión de la libertad religiosa en la comunidad tibetana. Se ha afirmado que se trataba de una tapadera de la Nueva Tradición Kadampa (NKT) y a menudo se sigue criticando a la NKT por ser la que llevó a cabo todas las protestas contra esta prohibición. Sin embargo, la verdad es que también había un gran número de tibetanos practicantes de Doryhe Shugden involucrados. El ISC ya no existe ahora que las protestas contra la prohibición por el Dalai Lama de la práctica del Protector del Dharma Dorye Shugden lograron cierta libertad religiosa. Los objetivos principales de la Nueva Tradición Kadampa-Unión Budista Kadampa Internacional (NKT-IKBU) y del ISC eran diferentes. El propósito de la NKT-IKBU es ayudar a que el budismo kadampa florezca en la sociedad contemporánea libre de la política. El propósito de la ISC era conseguir la libertad religiosa para los practicantes de Doryhe Shugden que estaban sufriendo como resultado de la prohibición implementada por el Dalai Lama. En particular: La NKT-IKBU, una organización benéfica registrada, se define como la asociación internacional de centros de estudio y meditación que siguen la tradición pura del budismo Mahayana derivada de Atisha y Yhe Tsongkhapa, introducida en Occidente por el Fundador de la NKT, Venerable Gueshe Kelsang Gyatso, y que exponen los tres programas de estudio de la NKT, y que se rigen por las Normas Internas de la NKT. El ISC, una empresa registrada, se definió como una coalición internacional de practicantes de Doryhe Shugden dedicada a lograr la libertad religiosa para cualquiera que desee dedicarse a esta práctica, y a restaurar la armonía, el respeto y la cooperación entre los practicantes budistas de Shugden y los que no lo son en todo el mundo. Aunque las diferencias entre las organizaciones son obvias, también hay áreas en las que coinciden. Tanto la NKT-IKBU como el ISC desean que el budismo florezca en este mundo libre de política. Además, ambas aprecian la práctica del Protector del Dharma Doryhe Shugden. Muchos practicantes de la NKT expresaron activamente su fe en Doryhe Shugden ayudando a apoyar y organizar las actividades del ISC. Eligieron participar como individuos dedicados a su práctica de Doryhe Shugden, no como miembros de la NKT-IKBU.